З метою концентрації менеджерських ресурсів виключно на фармацевтичному бізнесі, а також згідно стратегії розвитку 2001-2005 років, Takeda розпродала частину бізнесу, а саме ветеринарний, харчовий, сільськогосподарський бізнес, виробництво вітамінів, уретанових хімікатів, а також з захисту навколишнього середовища.
У 2005 році американське біопідприємство Syrrx, Inc. було інтегровано в глобальну мережу науково-дослідницьких центрів Takeda і в даний час перебуває під назвою Takeda California, Inc. На той час компанія Syrrx Inc. володіла найкращою у світі потужною рентгенівською кристалографічною технологією для аналізу білків. Інтеграція з Syrrx Inc. стала першим кроком до розширення програми винайдення ліків за межами Японії.
У 2005 році в США було випущено препарат Rozerem (непатентована назва: ramelteon), який мав інший механізм дії порівняно зі звичайними методами лікування безсоння. Його дія була наступною — вплив на рецептори мелатоніну, що викликало стан, близький до фізіологічно природнього сну і засинання без занепокоєння або тривоги.
У 2006 році у Великобританії було створено компанію Takeda Pharmaceuticals Europe Limited з метою реалізації стратегій у Європі із середньо- та довгостроковою перспективою, а також управління бізнесом.
Завершення будівництва нового головного офісу в Сполучених Штатах Америки для компаній Takeda Pharmaceuticals North America і Takeda Global R&D Center стало великим досягненням на шляху зміцнення присутності компанії в Північній Америці та розвитку діяльності в США.
У 2006 році до свого річного фінансового звіту Takeda включила інформацію про власні ініціативи щодо прав людини, навколишнього середовища та громад. Також було створено довідник із корпоративної соціальної відповідальності (КСВ), де інформація представлена в повному обсязі. Із метою збереження навколишнього середовища він доступний лише в електронному форматі PDF. Довідник КСВ містить більш детальну інформацію про КСВ проекти компанії.
У 2007 році, завдяки інтеграції Paradigm Therapeutics та її дочірньої компанії в Сінгапурі, Takeda ще більше розширила свої можливості у розробці нових ліків. Paradigm Therapeutics Ltd. — біологічне венчурне підприємство, створене дослідниками Кембриджського університету в 1999 році. Компанія Paradigm вже розробила багатообіцяючий портфель інноваційних лікарських засобів, який відповідає ключовим терапевтичним напрямам Takeda. Paradigm Therapeutics Ltd. в даний час функціонує під назвами Takeda Cambridge Limited (TCB) і Takeda Singapore Pte. Limited (TSP).
У 2009 році Takeda взяла участь у Глобальному договорі Організації Об'єднаних Націй, підтримуючи 10 принципів, що стосуються прав людини, праці, навколишнього середовища, протидії корупції та імплементувала їх в усі аспекти своєї діяльності. Takeda також розширила діяльність з соціальної відповідальності бізнесу та створила спеціалізовану КСВ-організацію.
Takeda сформувала довгострокові партнерські відносини з міжнародними неурядовими організаціями та іншими групами, щоб підтримати їх зусилля щодо покращення доступу до медичного обслуговування людей у країнах, що розвиваються. Takeda Initiative — це 10-річна грантова програма, що триватила з 2010 по 2019 роки. Вона була створена задля підтримки Глобального фонду боротьби зі СНІДом, туберкульозом та малярією, шляхом підвищення кваліфікації медичних працівників у трьох країнах Африки. Наприклад, у Нігерії в 2012 році в рамках програми, підтриманої Takeda Initiative, понад 11 тисяч викладачів пройшли курс навчання із проблем СНІДу, які згодом, у свою чергу, роз'яснювали, що таке СНІД понад 1,2 мільйонам студентам. Завдяки цим заходам рівень захворюваності на ВІЛ серед молоді в Нігерії почав падати.
Takeda розробила Глобальний кодекс поведінки, як базовий стандарт відповідності щодо єдиного підходу до питань дотримання правил ведення бізнес-діяльності для всіх компаній Takeda в усьому світі.
Азілва (непатентована назва: azilsartan) — це блокатор рецепторів ангіотензину II (БРА). Під час клінічних випробувань він продемонстрував високу ефективність у зниженні артеріального тиску порівняно з попередніми БРА.
У 2011 році було завершено будівництво науково-дослідного центру «Шонан», який розташований у містах Фуджісава та Камакура у префектурі Канагава. Установа була створена для інтеграції дослідних центрів в Осаці та Цукубі, як ядро глобальної наукової мережі Takeda для прискорення інновацій у розробці нових препаратів. Близько 1200 співробітників центру працювали на різних етапах процесу досліджень і розробок, починаючи від первинного пошуку молекул, відбору можливих сполук для доклінічних досліджень і до моменту запуску препаратів.
Інтеграція швейцарської фармацевтичної компанії Nycomed була завершена у вересні 2011 року. Nycomed має сильні позиції у Європі та країнах, що розвиваються. Завдяки цій інтеграції Takeda розширила свою присутність на ринках понад 70 країн і посилила свою експертизу й структуру продажів, що дало змогу постачати продукцію компанії більшій кількості пацієнтів і медичного персоналу по всьому світу.
Takeda, як учасник Програми Global Compact LEAD, сприяла розвитку та поширенню практик лідерства відповідно до десяти принципів Глобального договору ООН, що стосуються таких питань, як права людини, трудові стандарти, охорона навколишнього середовища та боротьба з корупцією.
З 2011 року Takeda підтримує відновлення районів, які постраждали від великого східно-японського землетрусу, передаючи частину прибутків від продажу препарату Алінамін — мультивітамінної харчової добавки. Компанія також підтримує низку інших довгострокових і постійних програми допомоги.
В останні роки вакцини мають величезний вплив на здоров'я людей у всьому світі. Компанія прийняла рішення про глобалізацію свого бізнесу вакцин, який уже понад 60 років активно функціонує в Японії і в 2012 році створила власний глобальний підрозділ з виробництва вакцин.
Діяльність підрозділу направлена на зміцнення позицій існуючого вакцинного бізнесу в Японії, на розробку вакцин для педіатрії, а також на розширення портфеля інноваційних лікарських засобів шляхом ліцензування нових потенційних вакцин і нових платформ для їх розробки.
・Завдяки інтеграції з URL Pharma, Inc. до лінійки продуктів Takeda було додано продукт Колкрис (colchicine) для лікування випадків загострення подагри.
・Інтеграція з Multilab Indústria e Comércio de Produtos Farmacêuticos Ltda дозволила значно розширити присутність компанії та її продукції в Бразилії.
・Інтеграція з LigoCyte Pharmaceuticals, Inc. (нині Takeda Vaccines (Montana), Inc.) посилила бізнес вакцин.
・Інтеграція з Envoy Therapeutics, Inc. дозволила посилити платформу з розробки нових лікарських препаратів для визначення нових цілей.
У 2012 Takeda впровадила світову політику охорони навколишнього середовища, здоров'я та безпеки життєдіяльності (НЗБ). Діяльність, пов'язана з НЗБ, охоплює різні питання, які мають важливе значення для світового співтовариства, такі як використання водних ресурсів та збереження біорізноманіття.
Конкретні майбутні плани включають оцінку та аналіз впливу продукції компанії впродовж їх життєвиого циклу на довкілля та детальний підхід до обліку використання природних ресурсів завдяки використанню LIME та інших засобів.
У 2012 році у Європі з’явився препарат Адцетріс для лікування рецидивуючої або рефракторної лімфоми Ходжкіна та системної анапластичної великоклітинної лімфоми, який був зареєстрований компанією Seattle Genetics, Inc. і випущений компанією Takeda в ЄС у 2012 році та 2014 році в Японії. Передбачалось, що для пацієнтів, які страждають рідкісними захворюваннями, даний препарат стане розповсюдженим напрямом лікування.
Лотріга (Omega-3-Acid Ethyl Esters 90) — рецептурний препарат, похідний від висококонцентрованого омега-3, який отримав ліцензію компанії Pronova BioPharma ASA. На той час це був перший рецептурний лікарський засіб, що містив EPA і DHA.
Розроблений компанією Takeda California, Inc., препарат для лікування діабету II типу Несіна (alogliptin benzoate) був випущений у США. Дія препарату Несіна полягала в наступному — зниження рівня глюкози в крові шляхом інгібування ферменту (DPP-4), який порушує глюкагоноподібний пептид-1 (GLP-1) — гормон, який стимулює секрецію інсуліну.
У грудні 2013 року Takeda підписала заяву генерального директора щодо підтримки принципів розширення прав і можливостей жінок (WEP). Це набір принципів для підприємств, які містять рекомендації щодо розширення прав і можливостей жінок на робочому місці. Дані принципи є результатом співпраці між Організацією Об'єднаних Націй з питань гендерної рівності та розширення прав і можливостей жінок (ООН-жінки) й Глобальним договором ООН.
З 2013 року Takeda дотримується 7 принципів для посилення своїх ініціатив щодо сприяння активній участі жінок у корпоративній діяльності.
Завдяки інтеграції компанії Inviragen, Inc. (розташованій у Колорадо, США), Takeda залучила інноваційні розробки та сучасні технології для створення як живих противірусних, так й інактивованих вірусних вакцин, що значно посилило присутність компанії на світовому ринку вакцин.
У 2013 році в США вийшов препарат Трінтелікс, призначений для лікування клінічної депресії. Його було зареєстровано компанією Lundbeck в Данії. За механізмом дії Трінтелікс відрізнявся від інших існуючих методів лікування депресії на момент випуску та очікувалось, що він допоможе багатьом пацієнтам з цим захворюванням. Назву продукту було змінено на Trintellix (раніше Brintellix) у 2016 році.
Ентивіо призначений для лікування пацієнтів із запальними захворюваннями кишечника. Цей препарат був випущений з метою запропонувати рішення для тих пацієнтів, які не мають бажаної реакції на існуюче лікування.
Нінларо був затверджений у США в 2015 році як перший пероральний інгібітор протеасоми. Він став результатом десятиліть наково-дослідних робіт з вивчення множинної мієломи, які відзначені Нобелівською премією.
В 2015 році Takeda разом із Центром досліджень та застосування ІПС клітин при Кіотському університеті розпочали спільну дослідницьку програму T-CiRA для вивчення клінічного застосування стовбурових клітин.
Інтеграції з ARIAD Pharmaceuticals у 2017 році дозволила Takeda посилити портфоліо препаратів для онкології та портфель лікарських засобів для терапії щільних пухлин.
У 2018 році був відкритий Shonan Health Innovation Park (Shonan iPark), як перша в Японії інноваційна екосистема для розробки передових рішень у галузі охорони здоров’я за підтримки фармацевтичних компаній.
У 2018 році Takeda відкрила глобальну штаб-квартиру Takeda в Ніхонбасі, Токіо. Будівля була розроблена з урахуванням різноманіття функцій та потреб співробітників, а також задля сприяння розвитку творчих здібностей на робочому місці.
У 2018 році Takeda стала єдиною фармацевтичною компанією в світі, яка має акції як на Токійській, так і на Нью-Йоркській фондових біржах.
У 2019 році Takeda завершила придбання Shire plc, ставши глобальною біофармацевтичною науково-дослідною компанією-лідером з присутністю у 80 країнах світу.